水权运营即水权制度运行,是通过政府法律、政策等引导,主要通过市场配置手段,对水资源开发、利用、治理与保护各环节的制度(机制)的运营过程,是水权运营主体对水资源产业化经营的市场化与非市场化的运作与经营活动。水权运营中政府与市场关系是非常复杂的问题,如何架构合理而科学的关系框架,既包括产权关系、运营关系与监管关系各环节,也包括制度创新与政府改革,同时有赖于社会主义市场经济的进一步完善与发展。