西藏地区紫堇属植物DNA条形码鉴定

作者:杨冬璠; 赵丽萍; 汪圣; 旦增顿珠; 徐福春*
来源:中药材, 2023, 46(04): 852-856.
DOI:10.13863/j.issn1001-4454.2023.04.010

摘要

目的:以ITS2序列和psbA-trnH序列作为DNA条形码,对西藏地区紫堇属植物进行分子鉴定。方法:通过比较两条序列的扩增成功率和测序成功率,分析序列特征,计算种内和种间的遗传距离,构建Neighbor-joining进化树,评价两条序列的鉴定效率。结果:两条序列的扩增成功率和测序成功率均为100%。psbA-trnH序列的最大种内遗传距离均小于最小种间遗传距离,符合DNA条形码对遗传距离的要求。系统进化树分析中,psbA-trnH序列能够有效地区分不同来源的紫堇属植物,而ITS2序列聚类效果较差。结论:psbA-trnH序列具有较高的鉴定效率,可作为西藏地区紫堇属植物物种鉴定的DNA条形码。该研究为西藏地区紫堇属植物的基因组学的深入研究夯实了基础,也为西藏紫堇属藏药的质量监控提供了新的方法。

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