摘要
NAC转录因子是植物中特有的转录因子,在非生物胁迫、激素信号应答以及组织器官发育中发挥着重要作用。为进一步研究赪桐NAC转录因子,本研究基于赪桐第三代全长转录组信息,利用生物信息学方法筛选获得57个赪桐NAC 转录因子,并对其进行系统进化、保守基序、理化性质以及蛋白质二级结构等预测和分析。赪桐NAC转录因子种内系统进化树分析结果表明,赪桐NAC 蛋白被划分为9个亚族,与拟南芥NAC家族进行系统进化树构建,可划分为17个亚族,且蛋白序列在亚族内呈现出进化关系的保守性。赪桐NAC蛋白在氨基酸数目以及氨基酸序列间的疏水性均存在差异,且多为亲水性蛋白。亚细胞定位预测表明,赪桐57个NAC蛋白均位于细胞核,且均具有潜在的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr) 磷酸化位点。二级结构预测显示,赪桐NAC 主要由随机卷曲构成,α-螺旋和β-转角在所有赪桐NAC 蛋白中均有分布。本研究通过筛选赪桐NAC 转录因子并进行生物信息学分析,可为后续赪桐NAC 家族基因功能研究提供参考。
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