黑果枸杞中调控花青素合成代谢的bHLH基因克隆与序列分析

作者：赵鑫; 李建民; 朱雪冰; 郑旭莹; 宗渊; 刘宝龙^*

来源：分子植物育种, 2018, 16(20): 6616-6623.

DOI：10.13271/j.mpb.016.006616

• 黑果枸杞
• bHLH
• 基因克隆
• 序列分析

以黑果枸杞为研究对象,利用RT-PCR方法从黑果枸杞cDNA中克隆一个bHLH的转录因子——LrJAF13,通过生物信息学的分析,发现该基因的全长为1 890 bp,编码624个氨基酸的亲水蛋白,其分子式是C3012H4843N853O978S24,分子量为6.94 kD,脂肪指数(Aliphatic index)为85.45,等电点pI为5.24,亲水性(Grand average of hydropathicity)为-0.497,不稳定指数(Instability index)为50.13,推断出该基因编码的蛋白位于细胞核中,蛋白质三维结构复杂,包含多个α-螺旋和β-折叠结构,与矮牵牛拟南芥bHLH基因编码的蛋白序列的一致性为88%,进化树的分析表明黑果枸杞的LrJAF13与矮牵牛的bHLH的转录因子petuniaJAF13的亲缘关系比较接近。通过上述分析,为解析黑果枸杞果实中高花青素含量的分子遗传机理、优异资源筛选和新品种选育提供了理论依据。

• 单位
  青海师范大学; 青海大学