基于生物信息学方法分析急性心肌梗死机制中铁死亡关键基因

作者：姚松; 梁鹏; 涂清鲜; 姜黔峰^*

来源：遵义医科大学学报, 2023, 46(04): 357-395.

DOI：10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2023.0053

• 急性心肌梗死
• 生物信息学
• 铁死亡
• 关键基因

目的 应用生物信息学方法分析急性心肌梗死中铁死亡相关基因，初步探索潜在生物标志物及治疗靶点。方法 从基因表达综合数据库(GEO)下载GSE66360数据集，并与Ferroptosis基因取交集，筛选与急性心肌梗死相关的铁死亡基因，采用GO、KEGG的功能富集分析，构建蛋白质相互作用网络，应用Cytoscape可视化模块内基因共表达关系，筛选出关键基因TLR4和ATF3。通过miRWalk 2.0进行筛选靶向关键基因的microRNA,通过受试者工作特征(ROC)分析关键基因诊断价值，采用ELISA进一步验证其表达。结果 共筛选出27个铁死亡相关差异表达基因，GO与KEGG的功能富集分析结果表明，它的作用可能和炎症、氧化应激、坏死和凋亡、脂质与动脉粥样硬化相关，基于蛋白质相互作用网络筛选出2个关键基因TLR4和ATF3,同时发现hsa-mir-155-5p作为靶向这2个基因的miRNA,TLR4和ATF3在AMI患者中表达水平上调，与对照组存在显著差异，绘制ROC曲线提示TLR4的AUC值0.9700,ATF3的AUC值0.9850,具有很高的诊断能力。结论 通过生物信息学方法分析TLR4和ATF3在AMI中的潜在作用，为AMI的铁死亡机制提供新的见解，有望成为潜在诊断生物标志物及治疗靶点。

• 单位
  遵义医科大学; 贵州航天医院; 第一临床学院