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摘要
目的对筛选的甲型肝炎病毒特异性基因进行生物信息学分析,为核酸扩增引物的设计提供理论基础,保证分子生物学检测方法的特异性。方法选择甲型肝炎病毒中的VP1基因序列,应用多种生物信息学数据库和软件,对VP1基因编码蛋白的性质、结构、功能和进化关系进行分析。结果对甲型肝炎病毒VP1基因编码的氨基酸序列组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、二级结构、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、信号肽以及蛋白功能的预测与分析,分析与其他肝炎病毒VP1蛋白的进化关系,从而推测甲型肝炎病毒VP1蛋白的功能及特异性。结论推断该基因具有高度保守性,可进行后续扩增引物的设计和筛选,用于分子生物学特异性检测方法的研究。
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