NaCl胁迫下柳树的转录组测序与初步分析

作者：李佳迪; 李子英; 丛日春^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(09): 2835-2841.

DOI：10.13271/j.mpb.018.002835

• ‘盐柳1号’
• ‘渤海柳1号’
• 盐胁迫
• 高通量测序
• 转录组分析

从组学水平分析盐胁迫下柳树内在分子机制，为柳树耐盐研究及耐盐基因的挖掘利用提供理论依据。本研究通过转录组测序技术对‘盐柳1号’(Salix psammophila ’Yanliu No.1’)和‘渤海柳1号’(Salix matsudana ’Bohailiu No.1’)经150 mmol/L NaCl胁迫处理后的叶片和正常叶片(对照)进行高通量转录组测序，并对获得的unigene进行从头组装和注释分析。结果表明：转录组测序共获得183 987条Unigenes，平均长度为1 080.18 bp，分别有120 130条、140 813条、98 066条、88 425条、47 982条、83 732条Unigenes被注释到NR、NT、SwissProt、KEGG、COG和GO数据库，共有149 864条(81.45%) Unigenes得到注释。在GO功能注释中，共得到55个GO功能小类，在KEGG代谢通路分析时，获得了135条KEGG通路。该转录组测序数据质量高，结果覆盖面广，为柳树耐盐基因挖掘和研究提供了一定的理论参考。

• 单位
  中国林业科学研究院