利用基因组数据挖掘对人类长非编码RNA进行功能注释（英文）

作者：Brian L.GUDENAS; Jun WANG; Shu-zhen KUANG; An-qi WEI; Steven B.COGILL; Liang-jiang WANG

来源：Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology), 2019, 20(06): 476-487.

• 长非编码RNA(lncRNA)
• 功能注释
• 基因组数据挖掘
• 机器学习

越来越多证据表明RNA在生物系统中扮演着重要的角色,而这些发现支持了生命起源于RNA的假设。在人类基因组中,大部分的基因并不编码蛋白质,被称为非编码RNA基因。长非编码RNA(lncRNA)是其中最大的一类,其转录本长度大于200个核苷酸。虽然一些lncRNA已被证明是调控基因表达和3D基因组结构的重要元件,但是大部分lncRNA还未被研究和注释。本课题组利用大量基因组数据,提出一些基于数据挖掘和机器学习的方法,对人类lncRNA进行功能注释。我们与其他同领域课题组的近期研究结果表明,基因组数据挖掘可帮助加深对lnc RNA功能的理解,并为与疾病相关lncRNA的实验研究提供重要信息。