液质联用技术中不同蛋白质鉴定策略的比较

作者：卫军营; 张养军; 陈明; 覃培斌; 王京兰; 蔡耘; 钱小红

来源：质谱学报, 2008, (04): 226-230+236.

• 酵母
• 液相色谱-串联质谱联用(LC-ESI MS/MS)
• 质谱分段扫描 yeast
• high performance liquid chromatography-electrospray tandem mass spectrometry(LC-ESI MS/MS)
• mass range

在常用的多维液相色谱-质谱联用技术中,采取延长梯度洗脱时间、进行重复实验、采用质谱分段扫描等多种方法,提高对蛋白质的鉴定效率。为了系统评价这些方法在复杂生物样本分析中的效果,应用酵母的蛋白提取物作为样本,在LCQ质谱仪上进行一系列的比较实验。结果表明,在一定范围内,随着梯度时间的延长,被鉴定的非冗余肽段(unique peptide)数量显著增加,相对应的蛋白质簇(group protein)数量也随之增加。同样,进行重复实验和采用质谱分段扫描的方法均能提高蛋白鉴定的覆盖率,而采用质谱分段扫描的策略具有更为显著的效果,因此在规模化蛋白质组分析中,应当选择更为合适的、互补的研究策略以提高结果的完...

• 单位
  蛋白质组学国家重点实验室; 北京蛋白质组研究中心; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所