新疆塔里木河叶尔羌高原鳅遗传多样性研究

作者:赵文浩; 易少奎; 苏君晓; 周琼; 沈建忠; 李大鹏; 周小云
来源:水生生物学报, 2022, 46(03): 364-374.
DOI:10.7541/2022.2021.006

摘要

为探究新疆塔里木河叶尔羌高原鳅(Triplophysa yarkandensis)遗传多样性现状, 研究基于线粒体Cytb和D-loop序列对塔里木河两条支流(车尔臣河和渭干河)的8个地理群体进行了遗传学多样性和遗传结构分析。结果显示, 基于Cytb和D-loop序列分别获得了41和51个单倍型, 单倍型多样性指数/核苷酸多样性指数分别为0.9247±0.0124/0.9776±0.0032和0.0065±0.0034/0.0115±0.0058, 表明各群体的遗传多样性水平均较高。AMOVA结果显示, 遗传变异主要来自群体内部(Cytb Fst=96.57%; D-loop Fst=95.25%), 仅有3.43%(Cytb)和4.75%(D-loop)来自群体间; 各群体间的遗传距离值小, 遗传分化指数Fst值低, 属于弱分化水平。基于样本构建的系统发育树和单倍型构建的网络进化图均显示, 各群体的样本没能形成明显的地理聚群和谱系结构。虽然两支流群体间存在潜在的遗传障碍, 并发生了一定的遗传分化, 但其遗传距离值只在0.05附近(Cytb, Fct=0.0540; D-loop, Fct=0.0471)。种群历史动态分析结果表明, 叶尔羌高原鳅种群相对稳定, 未经历过明显的扩张。综合上述结果, 塔里木河叶尔羌高原鳅群体遗传多样性水平较高, 但是遗传分化主要来源于群体内部, 群体间有明显的基因交流, 建议将其作为一个保护管理单元进行保护。研究为叶尔羌高原鳅种质资源开发利用、制定合理的保护措施提供了基础数据。

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