基于新型冠状病毒SARS-CoV-2主蛋白酶结构的小分子抑制剂虚拟筛选

作者：徐浩; 薛瑞; 李娟; 李波; 陈舟; 朴莲花; 常珊; 孔韧

来源：江苏理工学院学报, 2021, 27(02): 65-71.

DOI：10.19831/j.cnki.2095-7394.2021.02.010

• 分子对接
• COVID-19
• 虚拟筛选
• 主蛋白酶
• 小分子抑制剂

通过使用分子对接与虚拟筛选技术,以SARS-CoV-2主蛋白酶(Main Protease,Mpro)为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本进行分子对接,结合小分子的对接评分与结合模式分析,筛选出特异性作用于主蛋白酶的小分子抑制剂。结果发现,以SARS-CoV-2主蛋白酶原配体N3为对照,Reactive blue 2等分子具有更好的对接打分与合理的结合模式,或可成为潜在的主蛋白酶小分子抑制剂,可为寻找抗新冠病毒治疗药物提供线索。

• 单位
  江苏理工学院