增生性糖尿病视网膜病变关键基因和通路筛选及中药预测研究

作者：安琪; 杨宇峰^*; 石岩^*

来源：辽宁中医药大学学报, 2022, 24(09): 182-187.

DOI：10.13194/j.issn.1673-842x.2022.09.039

• 增生性糖尿病视网膜病变
• 生物信息学
• 中药预测
• 关键基因

目的 通过生物信息学筛选增生性糖尿病视网膜病变(proliferative diabetic retinopathy,PDR)差异基因(DEGs)，分析其发病机制，预测治疗PDR的潜在中药。方法 借助GEO数据库及其在线工具GEO2R获取PDR的DEGs，利用STRING、Cytoscape软件筛选出DEGs中的关键基因，通过R语言分析其主要涉及的生物过程与信号通路，将关键基因映射到Coremine Medical数据库中，对治疗PDR有效中药进行预测。结果 通过对GSE60436基因芯片处理共获得692个DEGs，筛选出RHO、COL1A1、GFAP等15个关键基因，主要涉及细胞外基质组织、视觉感知、胶原代谢过程等158个生物过程以及膀胱癌、AGE-RAGE信号通路、ECM-受体相互作用等18个信号通路，中药预测结果显示丹参、三七、人参、黄芩、厚朴为治疗PDR潜在药物。结论 PDR是多基因、多通路、多因素协同作用的结果，该文利用生物信息学挖掘PDR的关键基因，为其日后寻找诊断标志物以及有效治疗方案的制定提供新的视角。

• 单位
  辽宁中医药大学