摘要
目的 通过生物信息学筛选增生性糖尿病视网膜病变(proliferative diabetic retinopathy,PDR)差异基因(DEGs),分析其发病机制,预测治疗PDR的潜在中药。方法 借助GEO数据库及其在线工具GEO2R获取PDR的DEGs,利用STRING、Cytoscape软件筛选出DEGs中的关键基因,通过R语言分析其主要涉及的生物过程与信号通路,将关键基因映射到Coremine Medical数据库中,对治疗PDR有效中药进行预测。结果 通过对GSE60436基因芯片处理共获得692个DEGs,筛选出RHO、COL1A1、GFAP等15个关键基因,主要涉及细胞外基质组织、视觉感知、胶原代谢过程等158个生物过程以及膀胱癌、AGE-RAGE信号通路、ECM-受体相互作用等18个信号通路,中药预测结果显示丹参、三七、人参、黄芩、厚朴为治疗PDR潜在药物。结论 PDR是多基因、多通路、多因素协同作用的结果,该文利用生物信息学挖掘PDR的关键基因,为其日后寻找诊断标志物以及有效治疗方案的制定提供新的视角。
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