山东、广西地区新型鹅细小病毒全基因组扩增及遗传进化分析

作者：乔丹丹; 刘婷隽; 陈全刚; 李德宝; 周婕; 董淑红; 胡安康^*

来源：中国家禽, 2023, 1-12.

• 新型鹅细小病毒
• 全基因组序列
• 鸭
• 变异

为监测新型鹅细小病毒（Novel goose parvovirus,NGPV）的流行和变异情况，研究采集了山东和广西部分地区的鸭短喙综合征病料进行病原检测、全基因组扩增及序列比对分析。结果显示：共分离两株NGPV，山东分离株命名为SD202304，广西分离株命名为GX202304，两株病毒与2021年NGPV分离株HNXY21亲缘关系最近，全基因组序列相似性为99.1%;GX202304株末端重复序列（Inverted terminal repeat,ITR）有一段未见报道的51 bp基因插入；VP3编码氨基酸序列比对显示，在第290位GX202304株和SD202304株有一个苏氨酸到丙氨酸的突变，这是NGPV近年来发生的新变异位点。研究表明，从山东、广西地区分离到的两株NGPV存在51 bp新的基因插入片段和VP3新的突变位点，结果为我国NGPV感染的防控提供科学依据。

• 单位
  徐州生物工程职业技术学院; 徐州医科大学