基于转录组测序的海巴戟果实中乙烯调控相关基因表达分析

作者：胡丹焱; 张正雪; 刘娟; 蓝增全; 吴田^*

来源：四川农业大学学报, 2020, 38(05): 528-537.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.2020.05.004

• 转录组测序
• 海巴戟
• 果实后熟
• 乙烯调控

【目的】为了明确乙烯相关基因在海巴戟(Morinda citrifolia L.)果实采后后熟过程中的功能。【方法】以刚采摘的成熟海巴戟果实(0 d)和室温(25℃)后熟2 d的海巴戟果实为研究对象,通过转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量PCR技术(qRT-PCR),分析海巴戟果实的转录组数据、乙烯相关基因及其表达水平。【结果】海巴戟果实转录组经组装获得35 721个转录本,26 202个注释基因,筛选后获得3 754个差异基因(P≤0.05,LogFC≥2)。从差异基因中随机选取10个上调基因和10个下调基因进行荧光定量验证,结果表明转录组测序结果可靠。在乙烯合成途径和乙烯信号转导通路中发现4个乙烯合成相关基因-metK、ACS10、ACS12、ACO5和7个乙烯信号转导相关基因-ETR、CTR1、MAPK6、EIN2、EIN3、EBF1、ERF1,这11个基因在乙烯合成途径和乙烯信号转导通路中表达量较高且差异显著,选取其中表达量较高的metK、ACO5、EIN3和EBF1共4个基因进行荧光定量,进一步明确了这4个基因在海巴戟果实后熟过程中的重要作用。【结论】在乙烯合成途径和乙烯信号转导通路中发现的11个相关基因与海巴戟果实后熟和乙烯积累密切相关,可以从metK、ACO5、EIN3和EBF1入手,以继续进行海巴戟果实后熟机理研究。

• 单位
  西南林业大学