高等学校开展内部二级单位预算绩效评价是建立全方位、全过程、全覆盖的预算绩效管理体系,全面落实预算绩效管理的重要举措。作者在长期预算绩效评价实践工作中发现问题,分析原因,并从预算绩效评价组织体系、指标体系、信息化建设、结果运用等方面提出了对策。