摘要

目的 通过生物信息学分析影响前列腺癌进展的关键miRNA及其靶基因。方法 从GEO数据库获取前列腺癌miRNA数据集GSE36802及前列腺癌mRNA数据集GSE46602、GSE69223,通过GEO2R筛选差异表达的miRNAs,利用miRWalk、miRPathDB对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测并取交集。随后将筛选出前列腺癌相关差异表达基因与预测靶基因取交集最终得到差异表达基因。运用DAVID数据库对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,使用String数据库构建蛋白-蛋白互作网络,应用Cytoscape软件与CytoHubba插件筛选枢纽基因并通过GEPIA2数据库进行验证。结果 共获得4个在前列腺癌组织中上调的miRNAs,分别是miR-145-3p、miR-205-5p、miR-31-5p、miR-455-5p。最终共得出差异表达基因153个,其主要富集在RNA聚合酶II启动子转录的调节、信号转导、细胞黏附等生物过程及代谢途径通路、癌症通路、钙信号通路等通路中。通过蛋白互作网络得到10个备选枢纽基因,利用GEPIA2对枢纽基因进行表达差异验证,最终得到4个枢纽基因:IGF1、PPARGC1A、FGFR2、DPT。结论 本研究筛选出4个差异表达miRNAs和4个枢纽基因,为后续临床治疗和基础研究提供参考。