摘要

黑黄檀(Dalbergia fusca)是云南省濒危珍贵乡土树种,为分析其基因组中微卫星序列的特征,本研究通过Illumina高通量测序技术对黑黄檀全基因组进行测序,利用MISA软件进行分析。获得了12 962个微卫星序列,共7种类型,其中以单核苷酸重复类型最多,其次是二核苷酸类型。在各种类型中,AT含量显著高于GC含量。微卫星长度主要在10~20 bp之间,且在不同重复类型中,二核苷酸和单核苷酸长度变异较高,分别为有20和18种。本研究结果了解到黑黄檀基因组SSR分布规律,为其SSR引物的筛选及其种质资源遗传多样性研究提供理论依据。