摘要
探索SLE患者的肠道菌群特征, 并进一步挖掘SLE的菌群与CD4+T细胞亚群和疾病活动情况的关系。方法收集96例SLE患者和96例性别和年龄匹配的健康对照(HC)的粪便样本。采用16s rRNA测序法检测肠道菌群, 流式细胞仪检测外周血Th1、Th2、Th17、Treg等CD4+T细胞亚群。同时记录患者的ESR、CRP、血红蛋白(Hb)、补体C3和C4等疾病活动指标, 并记录每位患者的SLEDAI。利用edgeR算法进行差异丰度分析。采用Wilcoxon秩和检验比较各组间的alpha多样性指数、细菌丰度和F/B比值。采用R软件4.0.1进行统计学分析, 采用Pearson相关分析评估样品中细菌属相对丰度与血清ESR、CRP、C3和C4水平、CD4+T细胞亚群之间的相关性。结果与HC相比, SLE肠道菌群的丰度(ACE和Chao1)和多样性(Shannon和Simpson)指数显著降低。通过edgeR算法, 发现SLE和HC之间的肠道菌群差异有统计学意义。与HC相比, SLE患者在属水平上有24种细菌差异有统计学意义(P<0.05)。相关性分析提示:CRP与粪球菌属(Coprococcus)有显著正相关性(r=0.30, P=0.014);C4与棒状杆菌(Corynebacterium)(r=0.31, P=0.013)和粪杆菌属(Faecalibacterium)(r=0.25, P=0.048)呈正相关, 血红蛋白与摩根菌属(Morganella)(r=0.41, P=0.001)呈正相关;而疾病整体活动度与棒状杆菌属呈正相关关系(r=0.25, P=0.047)。B细胞(r=0.52, P=8.45×10-6)、Treg细胞(r=0.26, P=0.036)与挑剔真杆菌(Eubacterium eligens group)呈正相关关系, CD8+T细胞(r=0.20, P=0.034)、CD4+T(r=0.32, P=0.010)细胞、NK细胞(r=0.56, P<0.001)与棒状杆菌呈正相关关系, 除此之外, Th1与大肠志贺杆菌(Escherichia Shigella)(r=0.33, P=0.008)呈正相关关系, Th2与Dielma (r=0.51, P<0.001)呈正相关。结论 SLE患者肠道菌群的丰度和多样性显著降低, 多种差异表达的菌与患者的CD4+T淋巴细胞亚群和疾病活动指标密切相关。
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单位山西医科大学第二医院; 山西医科大学