基于ASFV EP402R编码蛋白CD2v的生物信息学分析

作者：张帅; 顾文源; 赵云环; 刘莹; 左玉柱^*; 范京惠^*

来源：河北农业大学学报, 2022, 45(02): 92-98.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2022.0030

• 非洲猪瘟
• CD2v
• 作用机制
• 生物信息学

为深入了解非洲猪瘟病毒（ASFV）的EP402R编码蛋白CD2v结构与功能的关系和病毒-宿主作用机制，本研究通过在线工具对Pig/HLJ/2018中国分离株CD2v蛋白进行了遗传进化和生物信息学分析。结果显示：Pig/HLJ/2018株与格鲁吉亚Georgia 2007、Georgia 2008以及其他中国毒株处于同一分支，基因型同为Ⅱ型；同一基因型CD2v蛋白氨基酸序列一致性高达100%，不同基因型间蛋白氨基酸序列表现出差异，氨基酸一致性在76.8%～81.7%之间；该CD2v蛋白表达的蛋白大小为41.008 89 kD；蛋白结构主要以无规卷曲为主；存在信号肽和跨膜区；存在4个优势B细胞表位和5个T细胞表位。结果表明：当前中国流行株为基因Ⅱ型；CD2v蛋白在ASFV入侵机体、免疫逃逸等过程中扮演重要角色，为ASFV的深入研究和ASF的防治奠定了基础。

• 单位
  河北农业大学