全外显子组测序对于智力障碍或全面发育迟缓患者的诊断价值

作者：李阳艳; 雷冬竹; 李彩云; 黄东群; 谭菊芳; 张昊晴^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2023, 40(06).

• 全外显子组测序
• 拷贝数变异测序
• 智力障碍
• 全面发育迟缓
• 诊断价值

目的探讨全外显子组测序(WES)对于智力障碍(ID)或全面发育迟缓(GDD)患者的诊断价值。方法选取2018年5月至2021年12月于郴州市第一人民医院就诊的134例ID或GDD患者为研究对象。采集患者及其父母的外周血样进行WES检测, 对候选变异进行Sanger测序/拷贝数变异测序(CNV-seq)验证和家系来源分析, 对候选变异根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)变异分类标准进行致病性评估。结果在134例患者中, 共检出致病性单核苷酸变异(SNV)及小片段插入/缺失(InDel)46例, 致病性基因组拷贝数变异(CNV)11例, 单亲二倍体(UPD)1例, 总体阳性检出率为43.28%(58/134)。46例致病性SNV/InDel共涉及40个基因62个位点, 其中最多的是MECP2基因(n=4)。11例致病性CNV中, 10例为缺失变异, 1例为重复变异, 片段范围为0.76 ～ 15.02 Mb。1例患者在15q11.2q12区存在约15.62 Mb的杂合性丢失(LOH), 结合家系WES数据提示为父源性UPD, 结合其临床表型诊断为Angelman综合征。结论 WES不仅能够高效检出SNV/InDel, 对CNV、LOH也有较高的检出率, 结合家系数据分析能够准确判断变异的来源, 这些优势表明WES对ID或GDD患者的遗传学病因诊断具有重要的价值。

• 单位
  南华大学; 郴州市第一人民医院