盐生草基因Unigene7547片段的克隆与分析

作者：周振国; 孟亚雄; 宋展树; 李葆春; 马小乐; 司二静; 汪军成; 王化俊^*

来源：分子植物育种, 2018, 16(22): 7281-7288.

DOI：10.13271/j.mpb.016.007281

• 盐生草
• 转录组
• 生物信息学
• 亲水性
• 亚细胞定位

为了从分子生物学角度研讨盐生草耐盐机理,挖掘耐盐基因,本研究以盐生草(Halogeton glomeratus)为材料,根据盐生草转录组测序结果,利用RT-PCR与SMARTer RACE技术克隆耐盐基因Unigene7547的cDNA全长,并应用生物信息学方法对该基因相关功能进行预测分析。结果克隆到Unigene7547基因的cDNA全长,该基因全长1 306 bp,开放阅读框为1 218 bp,编码405个氨基酸,分子量为45.16 kD,通过生物信息学分析显示,Unigene7547基因编码蛋白属于亲水性蛋白,呈酸性,无信号肽及跨膜区,亚细胞定位于细胞核内。发现Unigene7547中含有Thr、Ser、Tyr等磷酸化位点,主要以Thr、Ser磷酸化位点为主,可能影响细胞生理活动修饰调控等方面。Unigene7547基因蛋白二级结构中随机卷曲为37.78%、延伸链为28.89%、α螺旋为23.46%、β-转角为9.88%。该研究结果为进一步解析盐生草耐盐机理与培育耐盐新品种具有重要意义。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院