拮抗细菌DNA的CpG-N ODN筛选

作者：王良喜; 鲁永玲; 丁国富; 罗平; 周红

来源：解放军医学杂志, 2007, 32(01): 53-56.

DOI：10.3321/j.issn:0577-7402.2007.01.016

• DNA,细菌
• 脓毒症
• CpG基序
• 抑制性CpG寡核苷酸
• 分子设计

目的在抑制性CpG寡核苷酸(CpG-NODN)分子设计的基础上,选择部分序列加以合成并对其生物学活性进行鉴定,筛选出能够拮抗细菌DNA的CpG-NODN。方法对合成的10条CpGODN进行生物学活性的初筛和复筛,观察其自身的刺激性及其对CpG-SODN诱导的TNF-α释放的抑制作用。使用RNAstructureversion3.71预测CpGODN的二级结构及自由能,根据10条CpGODN构效关系分析结果,对CpG-NODN分子进行再设计,并从中选择11个序列进行生物活性的筛选。结果首次合成的10条CpGODN仅1条是对细菌DNA拮抗作用较弱的CpG-NODN。通过对其构效关系进行分析,推测CpGODN的生物活性可能与自由能相关。在此基础上对CpG-NODN分子进行了再设计,合成的11条CpGODN中有5条是拮抗作用较强的CpG-NODN。结论获得了6条CpG-NODN。CpGODN的生物活性可能与自由能密切相关。

• 单位
  第三军医大学