传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析

作者：陈丽; 薛瑜; 李广伟; 陈峰; 孙宝丽; 谢青梅

来源：动物医学进展, 2014, 35(03): 68-72.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2014.03.010

• 传染性支气管炎病毒
• S1基因
• 序列分析

近年来,鸡传染性支气管炎(IB)在我国广西地区相继暴发,流行十分广泛,给养禽业带来巨大损失。为及时了解传染性支气管炎病毒(IBV)的变异情况,从而进行更有效的防控,本研究对2012年分离自广西的8株IBV的S1基因进行了序列测定与分析。参考NCBI上的IBV S1基因序列,设计合成了一对扩增S1基因全长序列的引物。采用RT-PCR方法对8株IBV分离株(GX1-GX8)的S1基因进行克隆测序。序列分析结果表明,8株IBV分离株S1基因全长均为1620bp,且集中分布在2个分支,GX1-GX4属于第Ⅴ分支,其裂解位点均为RRFRR;GX5-GX8属于第Ⅰ分支,其裂解位点均为HRRRR,为IBV中国毒株所特有。同时,这些分离株进化趋势与其分离时间之间显示出一定的相关性;潜在糖基化位点(PGS)分析结果显示,GX1-GX4的PGS分布一致且与GX5-GX8的分布显示出一定的差异;核苷酸同源性分析结果表明,位于同一分支的毒株间同源性较高,所有分离毒株与我国使用的常规Mass型疫苗毒株的同源性均偏低。这暗示目前广西IBV分离毒株与我国广泛使用的IB疫苗毒株的遗传进化距离较远,常规Mass型疫苗可能起不到很好的免疫保护作用。

• 单位
  广东温氏食品集团股份有限公司; 华南农业大学