通过生物信息学技术预测铜绿假单胞菌噬菌体内溶素的作用机制

作者:孙卫忠; 胡晓梅; 饶贤才; 谭银玲; 陈志谨; 丛延广; 胡福泉
来源:第三军医大学学报, 2008, (09): 787-790.
DOI:10.16016/j.1000-5404.2008.09.001

摘要

目的对20种铜绿假单胞菌噬菌体基因组中可能的内溶素基因进行生物信息学分析,探讨其可能的作用机制。方法采用开放阅读框预测、同源检索、多重序列比对、蛋白质模型自动匹配等方法预测可能的内溶素及其内溶素相关基因。结果通过铜绿假单胞菌噬菌体基因组进行分析,新发现8种内溶素基因和2种穴蛋白基因,对新发现基因的类型做了相关推定。结论利用生物信息学手段分析已知序列,可以迅速、方便、有效地确定未知基因的功能及作用方式。

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