甲状腺癌差异表达基因的生物信息学分析

作者：盛福梅; 连旭; 韩崇旭^*

来源：实用临床医药杂志, 2021, 25(10): 1-10.

• 甲状腺癌
• 女性
• 生物信息学
• 差异表达基因
• 基因本体
• 京都基因与基因组百科全书

目的通过生物信息学方法筛选女性甲状腺癌(THCA)发生发展关键枢纽基因(Hub基因),探讨女性THCA发病机制。方法根据性别将1 780例诊断为THCA患者分为男性组(n=300)和女性组(n=1 480)。通过GEO芯片数据集GSE29265获取2组甲状腺癌及正常组织数据信息。分别筛选出2组癌组织、相对正常组织的差异表达基因(DEGs);构建DEGs的蛋白互作网络,并筛选Hub基因;采用基因本体(GO)数据库及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析THCA女性组Hub基因。结果分析发现女性THCA发病率是男性的4.93倍。女性组和男性组分别筛选出163个、165个差异表达为4倍以上的DEGs,以及分别筛选出10个、8个Hub基因,其中2组共有Hub基因4个,女性组特有Hub基因6个。女性组163个基因中,参与女性THCA生物学过程及相关信号通路的Hub基因有8个。结论 PROM1、EVA1A、PRSS23、ITGA2、NCAM1和KIT为女性THCA中特有的DEGs,其可能将成为女性THCA患者潜在的治疗靶点。

• 单位
  扬州大学; 江苏省苏北人民医院