构建宫颈癌铜死亡相关基因的预后模型和预测免疫治疗反应

作者：薛莘子; 赵悦; 张丹; 徐丹颖; 王侠^*

来源：激光生物学报, 2023, 32(03): 259-271.

• 宫颈癌
• 铜死亡相关基因
• 风险模型
• 免疫治疗
• 预后

为了探究铜死亡相关基因在宫颈癌（CC）中的预后价值，从TCGA数据库下载CC患者的临床资料，随机分为训练组和验证组。通过单因素Cox、LASSO-Cox和多因素Cox分析筛选出铜死亡相关基因，构建风险模型。通过Kaplan-Meier曲线分析两个亚组和整个队列的总生存期（OS）、受试者工作特征曲线（ROC）和主成分分析（PCA）验证模型的预后价值。通过单因素和多因素分析来评价临床特征和风险评分的独立预后价值。利用基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KGEE）富集分析两个亚组间的生物学功能和途径，并进一步分析了两个亚组对药物的敏感性。最终构建了5个与铜死亡相关基因（FXD1、ARF1、APP、HSF1、MT1A）的预后模型。从风险评分的生存曲线来看，低风险组的OS远超过高风险组，且预后良好（P<0.05）。单因素和多因素Cox分析表明，风险评分是独立的预后因素（P<0.001）。根据ROC和PCA证明了预后模型的预测能力。利用ROC曲线分析评估风险评分和其他临床特征（如年龄、分级和分期）的敏感性和特异性，结果表明，风险评分的预后价值优于其他临床特征。富集分析结果表明，基因功能主要富集于细胞外基质、细胞外结构。根据肿瘤免疫功能障碍与排斥（TIDE）算法，低风险组患者的免疫治疗疗效优于高风险组。此外还发现24种药物的敏感性在两个亚组中的显著差异。本研究建立了5个铜死亡相关基因组成的预后风险模型，并证明了该模型可以准确预测患者的预后，且低风险评分的患者更易从免疫治疗中获益，为临床个体化治疗提供理论依据。

• 单位
  徐州医科大学