奶牛瘤胃微生物BAC文库中ACCase基因的筛选与生物信息学分析

作者：赵圣国; 王加启; 卜登攀; 刘开朗; 朱雅新; 周凌云

来源：中国农业科学, 2011, (05): 1015-1021.

• 瘤胃微生物
• BAC文库
• 乙酰CoA羧化酶
• 基因注释
• 生物信息学 rumen microbiota
• BAC library
• acetyl-CoA carboxylase
• gene annotation
• bioinformatics analysis

【目的】从奶牛瘤胃微生物BAC文库中筛选含乙酰CoA羧化酶(ACCase)基因的克隆子,并对其全长测序和生物信息学分析。【方法】利用PCR序列驱动筛选法,从瘤胃微生物BAC文库中筛选ACCase基因,鸟枪法测定基因序列后,进行基因注释、比对和系统发育分析。【结果】筛选得到了含ACCase基因的克隆(U12),其插入片段序列(URE12)全长43 358 bp,GC含量为43.75%,经GeneMark程序预测含有38个基因,经Signature程序预测属于变形菌门。ACCase基因(Acc-32)编码159个氨基酸,与Elusimicrobium minutum的ACCase基因具有41%的相...

• 单位
  中国科学院微生物研究所; 微生物资源前期开发国家重点实验室; 动物营养学国家重点实验室; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所