各级环境监测站、社会环境监测机构的实验室正常运行时均会产生各种废水。废水主要来自两个来源:未监测废水和实验室本身产生的废水。废水中有许多有毒有害的物质。由于条件有限,实验室废水处理不能得到应有的重视。在许多地方,实验室废水处理极其简单。通过分析各级环境监测站、社会环境检测机构废水的特点,采取相应措施对废水进行处理,使监测分析中的废水污染降至最低水平,直至达标排放。