长链非编码TINCR介导乳腺癌化疗耐药的生物信息学分析

作者：董春涛; 王思琪; 费浩然; 司鑫鑫; 石晓^*

来源：医学信息(上旬刊), 2023, 36(15): 1-18.

• TINCR
• 乳腺癌
• 化疗耐药
• 生物信息学

目的 探讨长链非编码RNA-TINCR在耐药性乳腺癌中的表达、生物学功能、相关信号通路及其与患者预后的关系。方法 利用GEPIA在线数据库比较人乳腺癌组织和正常组织中TINCR基因的m RNA的相对表达水平，通过qPCR方法验证敏感、耐药乳腺癌细胞中TINCR的表达量，借助Kaplan-Meier ploter在线数据库分析TINCR表达量高低与乳腺癌患者生存预后的关系。采用CCK8法检测改变TINCR表达量对肿瘤细胞化疗敏感性的改变，Metascape在线数据库预测TINCR的相互作用蛋白，借助DAVID对相关基因功能进行GO和KEGG信号通路功能富集分析。最后初步探讨耐药细胞中异常表达的TINCR是如何产生的。结果 TINCR在乳腺癌组织及耐药乳腺癌细胞中高表达，升高TINCR表达水平可促进乳腺癌细胞对化疗药物的耐药，分析出TINCR相互作用蛋白有150个，这些蛋白调控蛋白质翻译、m RNA和rRNA的加工、mRNA的出核转运、核糖体小亚基的形成等生物学过程，信号通路富集结果主要分布在核糖体、冠状病毒疾病、剪切体、核质运输、m RNA监测通路等方面。TINCR启动子区具有ERα结合，且使用ERα抑制剂可显著抑制TINCR表达量。结论 TINCR在耐药乳腺癌细胞中呈高表达水平，与患者的预后不良有关，对乳腺癌化疗耐药的预测具有重要意义。