昭通牛mtDNA D-loop区遗传多样性分析

作者：朱群媱; 丁利民; 容斌; 邓琦炜; 胡瑀; 范新阳; 苗永旺^*

来源：云南农业大学学报：自然科学版, 2023, 38(06): 921-928.

DOI：10.12101/j.issn.1004-390X(n).202306010

• 昭通牛
• 线粒体DNA控制区
• 遗传多样性
• 母系世系
• 遗传分化

【目的】阐明昭通牛群体遗传背景信息。【方法】采用PCR产物直接测序技术对98头昭通牛样品的mtDNA D-loop区全序列变异进行检测，进一步将昭通牛的数据与已发表的云南文山牛、德宏高峰牛、滇中牛和迪庆牛的mtDNA数据进行联合分析。【结果】昭通牛mtDNA D-loop区序列共检测到73个核苷酸替换位点和3个插入/缺失。核苷酸替换位点约占检测核苷酸位点总数的8.13%，其中18个为单一信息位点，55个为简约信息位点，碱基替换主要为转换。在昭通牛群体中共确定36种单倍型，其中38.78%的个体属于H01～H09单倍型，源于瘤牛已发现的2个mtDNA世系，I1世系占37.76%,I2世系占1.02%；其余61.22%昭通牛个体分布于H10～H36单倍型中，都源于已发现的普通牛mtDNA世系，其中T2世系占5.10%,T3世系占43.88%,T4世系占12.24%。昭通牛群体的单倍型多样度为0.880±0.027，核苷酸多样度为0.024 43±0.000 94，群体内遗传距离为0.026±0.004，群体内遗传多样性指数为0.027±0.004。昭通牛与迪庆牛间的遗传距离和遗传分化最小，与德宏高峰牛间的遗传距离和遗传分化最大。【结论】昭通牛遗传多样性较丰富，与云南本地其他牛种存在一定遗传分化，在母系起源上为瘤牛和普通牛2个血统的混合起源，但受普通牛的影响较大。

• 单位
  云南农业大学; 昭通市农业科学院