高通量测序鉴定柑橘黄化脉明病毒诱导柠檬差异表达microRNA

作者：牛炳棵; 杨作坤; 王国平; 洪霓^*

来源：植物病理学报, 2018, 48(06): 799-809.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.000238

• 柑橘黄化脉明病毒
• 柠檬
• 深度测序
• microRNA
• 表达

柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)是我国新发生的危害柠檬的重要病毒。本研究对接种和未接种CYVCV的柠檬叶片样品进行了高通量小RNA测序,以甜橙基因组作为参考,采用生物信息学软件进行miRNA鉴定和靶基因预测。结果显示CYVCV侵染对13个保守miRNA和12个新鉴定的非保守miRNA的表达具有调控作用,对这些差异表达miRNA的靶基因进行预测和功能分析的结果显示,保守miRNA的靶基因功能在植物逆境反应及光合作用和能量代谢相关通路中具有明显的富集现象,推测与CYVCV侵染柠檬植株及诱导病害症状表现有关,而多数新鉴定的非保守miRNA的靶基因功能未能注释到KEGG通路。采用实时荧光定量PCR对部分miRNA的表达水平进行了分析,结果表明miRNA的表达水平在接种CYVCV后30～90d呈时间动态变化。研究结果为进一步揭示CYVCV与柠檬互作机制提供了重要信息。

• 单位
  农业微生物学国家重点实验室; 华中农业大学