DNA条形码识别Ⅵ:基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定

作者：范京安; 顾海丰; 陈世界; 莫帮辉; 温演庆; 何万兴; 刘伟; 曾晓茂

来源：应用与环境生物学报, 2009, (02): 215-219.

• 实蝇科
• COI基因
• DNA条形码
• 微型DNA条形码
• 物种鉴定 tephritidae
• COI
• DNA barcode
• minimalist DNA barcode
• species identification

选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料,将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码(mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析,探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性.采用虚拟实验(Silico analysis),将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段,通过构建NJ树,并进行遗传距离分析,得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%.同时做了实体实验(Empirical test),得到了果实蝇属6个物种的COI序列,将其与虚拟实验中的49个样本序列合并,以DNA-barcode指定序...

• 单位
  四川出入境检验检疫局; 中国科学院成都生物研究所; 中国科学院成都计算机应用研究所