行政公益诉讼制度试行、正式实施三年来取得了一定的成效。从线索发现、立案、调查核实证据、分析研判到提起公益诉讼(或不起诉)的各个环节都值得研究。经过调研,课题组发现,惠州市两级检察院形成了一定的办案模式,初步建立有惠州特色的行政公益诉讼工作制度体系,增强了诉前检察建议落实程度。存在的主要问题是:案件线索渠道单一,调查核实证据存在一定难度,提起公益诉讼的立案、起诉标准不统一,检察建议的效能和刚性有待进一步提高,人员素质、专业化水平有待提高。针对这些问题,课题组提出了相应的建议。