基于线粒体cytb和d-loop基因序列的东南沿海可口革囊星虫遗传多样性分析

作者：许瑞雯; 陈兴汉; 余祥勇^*

来源：海洋渔业, 2022, 44(03): 288-302.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2022.03.006

• 可口革囊星虫
• 遗传多样性
• cytb
• d-loop

为了解中国东南沿海可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)自然群体的遗传多样性水平，探明该物种的种质资源情况，采用线粒体细胞色素b(cytb)基因和线粒体DNA控制区(d-loop)序列分析技术对广东湛江(ZJ)、广东阳江(YJ)、广西钦州(QZ)、福建宁德(ND)、浙江温州(WZ)5个可口革囊星虫自然群体进行测序分析。在150个样本中，cytb和d-loop序列分别检测到了118和158个多态位点，定义了62和79种单倍型。基于cytb和d-loop序列的遗传多样性参数分析均表现出较高的基因多样性(cytb:0.871 3～0.963 2; d-loop:0.942 5～0.981 6)和较低水平的核苷酸多样性(cytb:0.032 487～0.040 975; d-loop:0.033 247～0.046 151)。而分子方差分析(AMOVA)结果一致表明，群体内部的遗传变异(cytb:98.56%;d-loop:98.61%)比例显著高于群体间的遗传变异(cytb:1.44%;d-loop:1.39%),表明可口革囊星虫在不同地理群体间的遗传变异并不明显，不同地理群体之间不存在地理隔离。单倍型邻接树的拓扑结构简单，未呈现明显的地理谱系结构。从Tajima’s D和Fu’s Fs检验结果显著偏离中性这一现象，可推测出可口革囊星虫群体近期经历过群体快速扩张事件。

• 单位
  阳江职业技术学院; 广东海洋大学; 华南农业大学