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摘要
LIM基因广泛存在于真核生物中，在调控基因的表达、信号转导和胁迫应答反应等方面中具有重要的调控作用。本研究基于紫鸭跖草的转录组测序数据，利用生物信息学工具筛选紫鸭跖草的LIM基因，并分析了LIM蛋白理化性质、亚细胞定位、蛋白结构和系统进化树。结果显示，筛选出16个紫鸭跖草LIM基因家族成员，其编码蛋白的长度在136 ～ 475 aa之间，蛋白分子量在14.97～54.64 kD之间，紫鸭跖草LIM蛋白大部分为稳定的碱性亲水蛋白，紫鸭跖草LIM蛋白的二级结构元件以无规则卷曲和α螺旋为主，紫鸭跖草LIM蛋白主要定位于细胞核和细胞质。系统进化树显示，紫鸭跖草LIM蛋白分为6个类群。本研究筛选和分析了紫鸭跖草LIM基因家族成员，为深入研究紫鸭跖草LIM基因家族的生物学功能提供了一定的理论基础。
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