同源蛋白序列比对探讨AmPR-10核酸酶活性机理

作者：王珏; 胡丽丽; 李桂兰; 吴娜; 张育敏^*

来源：生物学杂志, 2021, 38(05): 48-52.

• 蒙古黄芪病程相关蛋白
• 同源蛋白
• 分子对接
• 核酸酶活性

蒙古黄芪病程相关蛋白AmPR-10(Astragalus membranaceus pathogenesis-related protein-10)对黄芪生长发育及抗病机制有重要意义。研究检测出以大肠杆菌为宿主外源表达的AmPR-10具有核酸酶活性。将AmPR-10与其同源的7个已证明具有核酸酶活性的蛋白进行氨基酸序列比对,发现AmPR-10基因有4个高保守区段,分别是:14～24位、44～55位、64～70位及83～88位。其中第一段保守区与C-末端的α螺旋在空间上形成较强的疏水区以稳定蛋白空腔的结构,利于AmPR-10在抵御侵害时功能的发挥;另由分子对接和氨基酸单点突变发现第4段保守区的83位Tyr是AmPR-10具有核酸酶活性的关键位点,其突变会影响目标蛋白与底物结合的稳定性,而非保守区域140位Gly可作为基因进化的参考位点,当突变为Asn、Val及Trp时,AmPR-10与底物的结合自由能下降。以上结果对深入理解及优化AmPR-10的核酸酶活性具有理论指导意义。

• 单位
  山西中医药大学; 基础医学院