本发明公开了一种基于微流控芯片的益生菌电泳检测方法,先制备TBE-PEO运行缓冲液,然后利用其制备细菌悬浮液,经过衍生步骤,利用经预处理的微流控芯片进行电泳联用激光诱导荧光检测。本发明检测方法具有操作步骤简单易行,分析时间短,样品用量少,灵敏度高,分析结果准确等优点,适用于进行益生菌制品中的益生菌检测。