水稻白叶枯病菌第二信使c-di-GMP代谢酶基因的预测和分析

作者:薛丁榕; 田芳; 李海云; 杨凤环; 陈华民; 何晨阳
来源:生物技术通报, 2015, 31(11): 131-138.
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.11.016

摘要

旨在从水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)中鉴定出含有GGDEF结构域的鸟苷酸环化酶(DGC)和含有EAL或HD-GYP结构域的磷酸二酯酶(PDE)编码基因。预测分析了Xoo已测序菌株中的GGDEF、EAL和HD-GYP结构域蛋白的种类、数量及其序列特征,鉴别了基序保守的DGC或PDE、基序退化的信号受体以及信号输入结构域,验证了部分不同类型结构域蛋白作为DGC/PDE、信号受体以及在细菌毒性调控等方面的功能。

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