象耳豆根结线虫actin基因的克隆与分析

作者：练冬梅; 赵志祥; 陈绵才; 王会芳

来源：西南农业学报, 2014, 27(03): 1091-1095.

DOI：10.3969/j.issn.1001-4829.2014.03.036

• 象耳豆根结线虫
• Actin基因
• 全长cDNA

采用RT-PCR、cDNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫生长发育关键基因actin的全长cDNA序列(登录号:KF534787),并与NCBI核酸数据库进行序列比对,结果表明:序列全长1298 bp,包含一个全长1125 bp的开放阅读框ORF,编码375个氨基酸,起始密码子在82位,终止密码子在1207位,与已知的其它物种的actin具有高度的保守性,与马铃薯腐败线虫和松才线虫actin的同源性分别为99.20%和98.67%,与秀丽隐杆线虫、人类相似性分别达到98.67%和97.33%。系统发育分析表明,象耳豆根结线虫actin可能是β-actin,同时也发现了象耳豆根结线虫actin与人类的胞质actin(β-actin)更相似。本研究填补了GenBank数据库中象耳豆根结线虫内标参照基因的空白。

• 单位
  海南省农业科学院; 植物保护研究所; 海南大学