适用于第2代测序技术的宏基因组DNA提取方法

作者：李昂; 崔迪; 王继华; 张斯; 杨基先; 马放

来源：哈尔滨工业大学学报, 2012, (06): 20-23.

• 宏基因组测序
• 宏基因组DNA
• 活性污泥
• Solexa测序 metagenomic sequencing
• metagenomic DNA
• the activated sludge
• Solexa sequencing

为快速、高效、大量地获得城市污水处理厂活性污泥中的宏基因组DNA,将3种不同的基因组DNA提取方式进行对比.结果显示,采用液氮研磨+基因组提取试剂盒相结合的方法获得的宏基因组DNA信息量最大,质量好,D(260/280 nm)在1.69～1.72.在进行高通量测序前的样品制备过程中,样品经过初步处理后宏基因组D(260/280 nm)达1.83,满足文库构建要求.利用Solexa Genome Analyzer System测序结果显示,两个样品正向测序结果良好,可用于序列拼接的高质量数据条数占90.8%.

• 单位
  哈尔滨师范大学; 哈尔滨工业大学; 城市水资源与水环境国家重点实验室