基于线粒体COⅠ基因序列的东南太平洋茎柔鱼群体遗传结构分析

作者：刁乐; 宋炜^*; 蒋科技; 黄洪亮; 马春艳; 张凤英; 陈雪忠; 马凌波

来源：海洋渔业, 2020, 42(03): 266-276.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2020.03.002

• 茎柔鱼
• COⅠ基因
• 遗传多样性
• 遗传结构

茎柔鱼广泛分布在东太平洋海域,分布水域广,种群结构复杂。采用线粒体COⅠ序列为遗传标记分析了东南太平洋茎柔鱼(Dosidicus gigas)遗传结构特征。在秘鲁外海8个群体239个样本的线粒体COⅠ序列中共检测到46种单倍型,42个变异位点。8个群体的单倍型多样性为(0.469±0.114)～(0.759±0.086),核苷酸多样性为(0.001 04±0.001 07)～(0.003 63±0.001 21),均具有较高的单倍型多样性水平和较低的核苷酸多样性水平。基于单倍型构建的NJ树以及基于群体间遗传距离构建的UPGMA树分析显示,8个群体间没有明显的地理谱系结构特征。AMOVA及Fst分析结果表明,群体间变异百分比为0.26%,群体内变异百分比为99.74%,说明遗传变异主要来自群体内部,群体间不存在显著的遗传结构分化。群体间的基因流数据分析表明,各群体间具有显著的基因交流。研究结果可为茎柔鱼资源的合理利用、开发及科学管理提供必要参考。

• 单位
  上海海洋大学; 中国水产科学研究院东海水产研究所; 生命学院