上皮-间充质转化过程导致结直肠癌远处转移的关键基因筛选和分析

作者：尚作宏; 钟彬; 张钦泉; 董毅; 马丹丹; 张建新; 沈雁兵^*

来源：中华实验外科杂志, 2023, 40(01): 145-148.

DOI：10.3760/cma.j.cn421213-20220504-01152

• 结直肠癌
• 生物信息学分析
• 上皮-间充质转化
• 转移

目的本研究通过生物信息学方法确定通过上皮-间充质转化(EMT)调控影响结直肠癌远处转移的关键基因, 并探究分子机制和预后。方法通过分析Enrichr数据库中的基因组, 获得EMT和转移性结直肠癌之间共同表达的枢纽基因。基因表达谱数据动态分析(GEPIA)被用来分析识别关键基因。利用多个生物信息数据库公布的数据, 分析关键基因在结直肠癌中的表达和功能富集。利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达谱数据库(GEO)探讨关键基因与结直肠癌病理特征和预后之间的关系, 并利用京都基因和基因组百科全书(KEGG)探究可能存在的通路及分子机制。结果两个关键基因P21活化激酶1(PAK1)和转化生长因β3(TGFB3), 分析与预后及病理特征关系。结果显示, PAK1低表达组的总体生存率低于高表达组[风险比(HR)=0.641, P<0.05], TGFB3高表达组的总体生存率低于低表达组(HR=1.561P<0.05)。TGFB3的表达水平与结直肠癌的M分期(t=6.314, P<0.05)、病理分期(t=4.368, P<0.05)和N分期(t=5.843, P<0.05)显著相关;PAK1高表达组与人种(t=2.367, P<0.05)、病理分期(t=1.540, P<0.05)、N分期(t=1.677, P<0.05)和M分期(t=7.561, P<0.05)显著相关。KEGG路径分析确定了PAK1和TGFB3靶基因分别在"细胞因子受体相互作用"和"肌动蛋白细胞骨架调节"中的起着关键作用。结论 PAK1和TGFB3可能通过相关的分子机制影响结直肠癌的上皮-间充质转化, 并与预后明显相关。

• 单位
  第一临床医学院; 南方医科大学