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摘要
为了了解条斑紫菜海藻酸盐裂解酶PyAly(Porphyra yezoensis alginate lyase)的结构与功能,试验通过生物信息学方法分析其理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、结构及进行多序列比对,并将建模得到的结构进行分子动力学模拟。结果表明:PyAly为亲水性蛋白,N端1-25位为信号肽,下游区域位于胞内,二级结构中无规则卷曲和α-螺旋占比较高,三级结构具有明显β-jellyroll结构,属于PL-7蛋白家族,尚未发现与其同源性较高的真核生物来源蛋白,活性位点处的保守氨基酸残基对其功能的发挥具有重要作用。优化后的蛋白结构较为合理,可为PyAly酶解机理研究奠定基础。
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单位福建师范大学福清分校
