科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
为了解皱紫菜与其他紫菜间的亲缘关系，本研究以皱紫菜丝状体为材料，提取叶绿体DNA，对叶绿体基因组进行测序、组装，并对其结构、大小、基因构成、简单重复序列位点、密码子偏好性以及系统发育进行分析。结果显示，皱紫菜叶绿体基因组长度为195 597 bp，包括大单拷贝区，小单拷贝区和两个反向重复序列。GC含量为31.56%，共鉴定到34个简单重复序列位点(simple sequence repeat， SSR)，其中二碱基以AT为重复基序的SSR数量最多。皱紫菜叶绿体基因组基因密码子偏好性较弱，较为偏好使用以A/U结尾的密码子。皱紫菜叶绿体基因组中亮氨酸密码子使用频率最高，半胱氨酸使用频率最低。共注释到208个基因，主要集中在光合作用、转录和未知功能基因上。系统发育分析结果表明，在不同紫菜中皱紫菜独自聚为一小支。
- 单位
