新型人腺病毒55型在中国10年的持续流行及其基因进化分析

作者：毛乃颖; 朱贞; 雷振强; 李岩; 黄芳; 尹洁; 陈萌; 向星宇; 李红; 唐浏英; 崔爱利; 李忠; 刘倜; 许文波

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 32(02): 124-129.

• 新型腺病毒55型
• 急性呼吸道感染
• 贝叶斯进化分析
• 基因

目的了解新型腺病毒55型(HAd V-55)在中国的流行状况和基因变异及进化规律,为其预防和控制提供科学依据。方法本研究对2011—2014年在中国5个省市(北京、河北、山东、湖南和云南)发热呼吸道症候群患者标本中分离到的HAd V-55毒株进行了hexon、fiber和penton base三个基因的序列测定,同时下载Gen Bank数据库中中国以及全球其他国家和地区、不同时间流行的HAd V-55病毒株的三个基因的序列进行比对,并利用多种序列分析软件进行了同源性和基因进化分析。结果 2006—2016年10年期间,在中国的15个省(市、自治区和直辖市)分离到HAd V-55病毒。进化分析结果显示,HAd V-55的三个主要结构基因均高度保守,其核苷酸和氨基酸序列同源性均大于99%;HAd V-55病毒在进化上是极为保守稳定,在进化树上聚集在一个分支,并有一定的时间聚集进化趋势。HAd V-55的hexon和fiber基因进化速率分为5.228×10-5和1.238×10-4substitutions/site/year,hexon基因的最早共同进化祖先t MRCA可追溯到1963年。结论 HAd V-55已经在中国形成了广泛传播和持续流行态势,建立有效的监测系统和开展疫苗相关研究对于其预防和控制至关重要。

• 单位
  山东省疾病预防控制中心; 河北省疾病预防控制中心; 北京市疾病预防控制中心; 云南省疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 湖南省疾病预防控制中心