枇杷果实坐果前后差异基因筛选

作者：任燕; 张学英; 安海山; 徐芳杰; 蒋爽^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(24): 8022-8029.

DOI：10.13271/j.mpb.018.008022

• 枇杷
• 转录组测序
• 膨大基因
• 开闭萼

枇杷(Eriobotrya japonica)在坐果前后,小果花萼由开放状态转为闭合状态。为获得这一过程中促进果实发育膨大的相关基因,本研究以‘火炬’、‘田中’和‘白玉’开萼和闭萼的果实为试验材料,进行转录组测序分析。共获取40 Gb测序数据,每个样本的数据量在6.67～6.88 Gb之间,平均为6.75 Gb。对测序数据进行重头拼接后获得37 129个Unigene。分离鉴定到了518个共性差异表达基因。根据注释信息筛选出16个基因可能与枇杷开闭萼前后促进果实发育有关。其中包括6大类:WOX基因、赤霉素相关基因、生长素结合蛋白相关基因、扩张蛋白基因、脱落酸相关基因和乙烯相关基因。前4类与细胞分裂和增大直接相关,在坐果后发生显著上调表达。后2类中脱落酸和乙烯均与落果有关,在授粉后,这些基因被显著抑制。每个大类选择1～2个基因进行荧光定量验证,结果显示这些基因的荧光定量结果和转录组的FPKM值趋势吻合。该研究为枇杷坐果提供重要的分子理论指导,相关的差异基因的挖掘有助于枇杷坐果的分子机制解析。

• 单位
  上海市农业科学院