基于高分辨率熔解曲线的银杏SNP分型方法构建

作者：吴雅琼; 辛月; 王建文; 祁铭; 荣浩; 徐立安^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(15): 5066-5073.

DOI：10.13271/j.mpb.017.005066

• 银杏(Ginkgo biloba L.)
• 高分辨率熔解曲线
• 单核苷酸多态性
• 基因分型

本研究旨在探究利用高分辨率熔解曲线(HRM)进行银杏SNP分型的最优体系。试验结果表明:使用Forget-Me-NotTMqPCR Master Mix Eva Green染料(10μL反应体系),引物浓度为0.1μmol/L,DNA浓度2.5 ng/μL情况下,银杏SNP分型能取得较好的区分效果。结果显示本体系有高通量、方便快捷和经济实用等优势。本研究建立的银杏SNP基因分型体系适合一次试验对单位点、多个体情况下的SNP鉴定和快速分型。利用优化的HRM体系,从银杏转录组数据中筛选获得了22个阳性SNP位点,并在3个银杏地区(90个个体中)进行了分型验证。该方法将在林木遗传图谱构建、品种鉴别、遗传多样性研究等方面有广泛应用前景。

• 单位
  南京林业大学; 南方现代林业协同创新中心