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摘要
目的探讨环状RNA（circRNA）表达谱在RAW264.7细胞自噬模型中的差异表达及其在细胞自噬过程中的调控作用。方法利用雷帕霉素（rapamycin, RAPA）和3-甲基腺嘌呤（3-methyladenine, 3-MA）分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导模型和自噬抑制模型;提取各组细胞总RNA,基于高通量测序技术获得差异表达的circRNA;运用生物信息学分析对circRNA可能结合的微小RNA（miRNA）及其可能参与自噬的分子通路进行预测。结果在RAPA组和3-MA组中呈现相反表达趋势的circRNA共有42个,差异显著的前5个circRNA分别是circRNAmmucirc0000353、mmucirc0001704、mmucirc0013108、mmucirc0001528和mmucirc0015842,分别对其结合匹配值较高的3个miRNA位点进行预测,GO分析表明这些miRNA与转录调控、炎症反应及免疫应答相关;KEGG分析表明与多条自噬相关通路有关。结论本研究筛选到的circRNA以及与之结合的miRNA与细胞自噬的发生发展相关,可以此为靶点进行自噬相关的研究,并为自噬调控机制提供基础。
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