CALB2介导的肿瘤微环境免疫细胞浸润在肝癌复发中的作用机制分析

作者：葛继芸; 姚晨; 张菁; 王礼玲; 解方园; 鲍蕾蕾; 黄玉凤^*

来源：海军军医大学学报, 2022, 43(07): 744-751.

DOI：10.16781/j.CN31-2187/R.20210889

• 肝肿瘤
• 复发
• 核心基因
• 预测模型
• 癌症基因组图谱
• 基因表达汇编

目的 利用生物信息学技术筛选与肝癌复发相关的核心基因及信号通路，为探索肝癌复发的分子机制提供理论依据。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达汇编(GEO)数据库下载肝癌相关数据集，利用edgeR算法筛选差异表达基因。对差异表达基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建确定肝癌复发相关核心基因。选择核心基因后，应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)-logistic回归分析构建肝癌复发预测模型。应用单样本基因集富集分析(ssGSEA)、使用表达数据估计恶性肿瘤组织中的基质细胞和免疫细胞(ESTIMATE)及微环境细胞种群计数器(MCP)方法评估免疫浸润细胞。结果 共筛选出343个肝癌复发相关差异表达基因。GO及KEGG富集分析结果表明，差异表达基因主要富集于前脑发育、化学突触传递的调节等生物过程及神经激活配体-受体相互作用等信号通路。PPI分析筛选出12个核心基因。通过对12个核心基因进行LASSO-logistic 回归分析，确定的独立风险评分模型为风险评分=22.1-生长抑素(SST)表达值×0.21-多巴胺 D2 受体(DRD2)表达值×1.94-钙结合蛋白 2(CALB2)表达值×1.153。该风险评分模型显示出较好的预测能力，AUC值为0.683。CALB2在肿瘤组织中低表达，与复发性肝癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞浸润呈正相关。结论 肝癌复发风险评分模型可以提供较好的复发预测能力，其中的核心基因CALB2可以在肝癌复发中发挥关键作用。

• 单位
  中国人民解放军第二军医大学