人体心肌内和血液中衰老相关长链非编码RNA的综合分析

作者：田佳瑜; 程子超; 赵锦阳; 范谦

来源：中国医药, 2019, 14(05): 673-676.

• 衰老
• 长链非编码RNA
• mRNA
• 基因表达谱

目的探讨人类心肌和血液标本中长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA的表达谱,分析人体心肌和血液标本中富集的与衰老相关的lncRNA,预测其潜在生物学功能和通路。方法对19对祖孙(老年组和青年组)的38份血液样本和7例接受心脏手术患者的心肌组织进行lncRNA和mRNA基因微阵列分析,筛选老年组和青年组血液标本差异性表达的lncRNA和mRNA,对血液样本中的差异基因、血液样本中富集的基因及心肌组织样本中富集的基因求交集并绘制Venn图,对筛选出的心肌衰老相关的差异基因进行通路分析,利用共表达网络分析筛选出起核心作用的mRNA和lncRNA,并推测哪些mRNA和lncRNA之间具有调控关系。结果在人类心肌标本中共检测到75 434个lncRNA和20 666个mRNA,在人类血液标本中共检测到75 434个lncRNA及20 666个mRNA,其中老年组与青年组差异性表达的lncRNA 2 835个,差异性表达的mRNA 959个。筛选血液标本中富集的lncRNA共24 281个、心肌标本中富集的lncRNA共23 980个与血液标本中具有衰老差异的lncRNA的交集,共得到可代表与心肌衰老相关的差异lncRNA720个;筛选血液标本中富集的5 554个mRNA、心肌标本中富集的4 520个mRNA与血液标本中具有衰老相关差异的959个mRNA的交集,共得到可以代表与心肌衰老相关的差异mRNA 63个。通过共表达网络图辅助发现lncRNA与mRNA之间可能存在的作用关系,找到影响mRNA表达的lncRNA,有助于发现网络中起中心调控作用的lncRNA及其可能存在的新作用机制。结论基因微阵列分析人类心肌和血液中lncRNA的表达谱,并对其进行潜在功能及通路的预测和分析,可为未来lncRNA和心肌衰老的相关研究提供参考及帮助。

• 单位
  北京市心肺血管疾病研究所; 首都医科大学附属北京安贞医院